Polinton
Los polintones o mavericks (también llamados polintovirus) son una superfamilia de grandes transposones de ADN que tienen homología con proteínas virales. Fueron descubiertos a mediados de la década de 2000. Son los transposones de ADN más grandes y complejos conocidos. Los polintones se transfieren verticalmente (de padres/madres a hijos). Se encuentran en los genomas de la mayoría de los eucariotas, exceptuando a las plantas, algas verdes y algas rojas que pudieron deshacerse de los polintones durante su evolución.[1][2][3][4][5][6]
Caraceterísticas
editarUn polinton típico tiene un tamaño de alrededor de 15 a 20 kilopares de bases, aunque se han descrito ejemplos de hasta 40 kb.[7] Los polintones codifican hasta 10 proteínas, siendo los elementos clave la ADN polimerasa de tipo B y la integrasa de tipo retroviral de la que derivan su nombre.[6] Los polintones a veces se denominan transposones "auto-sintetizados", porque codifican las proteínas necesarias para replicarse. La mayoría de los polintones también codifican una cisteína, una proteasa adenoviral, una FtsK, una ATPasa y una proteína en rollo de gelatina vertical típica de los virus de Varidnaviria. La presencia de esta proteína viral putativa ha provocado sugerencias de que los polintones pueden formar viriones no infecciosos en determinadas condiciones, sin embargo esto no se ha podido demostrar experimentalmente.[4][6][8]
Las secuencias de los polintones contienen repeticiones terminales invertidas características de los transposones, generalmente del orden de 100-1000 pares de bases. También poseen una secuencia de duplicación del sitio objetivo de 6 pb en el sitio de inserción.[4][7]
El protozoo Trichomonas vaginalis tiene un genoma compuesto por hasta un 30% de transposones polintones.[3]
Origen
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Según los análisis filogenéticos los polintones se originaron de los virus del dominio Varidnaviria mediante un proceso de endogenización en el cual los virus introducen su material genético en el genoma de las células huéspedes, por tanto los polintones podrían considerarse elementos virales endógenos. Los polintones derivan de bacteriófagos emparentados con Tectiviridae y pudieron ser los primeros virus eucariotas de este dominio y antes de integrarse al genoma eucariota originarían a los adenovirus, los virófagos, los virus gigantes, los plásmidos mitocondriales (plásmidos inactivos que se encuentran en las mitocondrias), los plásmidos citoplasmáticos (plásmidos de levaduras) y los transpovirones (transposones de ADN que se encuentran en los genomas de los virus gigantes).[4][6][9] [10]
Debido a su origen viral se llaman a menudo "polintovirus" y se ha propuesto asignarles una categoría taxonómica en la taxonomía viral. Los viriones de los polintones probablemente fueron similares a los viriones de los virófagos.[8]
Referencias
editar- ↑ Dupuy, C.; Periquet, G.; Serbielle, C.; Bézier, A.; Louis, F.; Drezen, J-M (31 de marzo de 2011). «Transfer of a chromosomal Maverick to endogenous bracovirus in a parasitoid wasp». Genetica 139 (4): 489-496. doi:10.1007/s10709-011-9569-x.
- ↑ Kapitonov, V. V.; Jurka, J. (14 de marzo de 2006). «Self-synthesizing DNA transposons in eukaryotes». Proceedings of the National Academy of Sciences 103 (12): 4540-4545. PMC 1450207. PMID 16537396. doi:10.1073/pnas.0600833103.
- ↑ a b Pritham, Ellen J.; Putliwala, Tasneem; Feschotte, Cédric (April 2007). «Mavericks, a novel class of giant transposable elements widespread in eukaryotes and related to DNA viruses». Gene 390 (1–2): 3-17. PMID 17034960. doi:10.1016/j.gene.2006.08.008.
- ↑ a b c d Krupovic, Mart; Koonin, Eugene V. (22 de diciembre de 2014). «Polintons: a hotbed of eukaryotic virus, transposon and plasmid evolution». Nature Reviews Microbiology 13 (2): 105-115. PMC 5898198. PMID 25534808. doi:10.1038/nrmicro3389.
- ↑ Yutin, Natalya; Shevchenko, Sofiya; Kapitonov, Vladimir; Krupovic, Mart; Koonin, Eugene V. (11 de noviembre de 2015). «A novel group of diverse Polinton-like viruses discovered by metagenome analysis». BMC Biology 13 (1). PMC 4642659. PMID 26560305. doi:10.1186/s12915-015-0207-4.
- ↑ a b c d Krupovic, Mart; Koonin, Eugene V (June 2016). «Self-synthesizing transposons: unexpected key players in the evolution of viruses and defense systems». Current Opinion in Microbiology 31: 25-33. PMC 4899294. PMID 26836982. doi:10.1016/j.mib.2016.01.006.
- ↑ a b Haapa-Paananen, Saija; Wahlberg, Niklas; Savilahti, Harri (September 2014). «Phylogenetic analysis of Maverick/Polinton giant transposons across organisms». Molecular Phylogenetics and Evolution 78: 271-274. PMID 24882428. doi:10.1016/j.ympev.2014.05.024.
- ↑ a b c Krupovic, Mart; Bamford, Dennis H; Koonin, Eugene V (2014). «Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses». Biology Direct 9 (1): 6. PMC 4028283. PMID 24773695. doi:10.1186/1745-6150-9-6.
- ↑ Yutin, Natalya; Raoult, Didier; Koonin, Eugene V (2013). «Virophages, polintons, and transpovirons: a complex evolutionary network of diverse selfish genetic elements with different reproduction strategies». Virology Journal 10 (1): 158. PMC 3671162. PMID 23701946. doi:10.1186/1743-422X-10-158.
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (October 2019). «Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins». ICTV Proposal (Taxoprop): 2019.003G. doi:10.13140/RG.2.2.14886.47684.
Datos: Q28209272
