CHARMM
CHARMM (Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics) es el nombre de un conjunto de campos de fuerza de mecánica molecular así como el nombre de un popular paquete para realizar y analizar simulaciones de dinámica molecular.[1][2] El equipo de desarrollo de CHARMM es una red global que trabaja con Martin Karplus y su grupo en la universidad de Harvard. Las licencias para trabajar con CHARMM tienen un costo para usuarios académicos. La principal ventaja de CHARMM sobre otros paquetes sin costo es la gran cantidad de herramientas para el análisis estadístico y termodinámico de las trayectorias moleculares.
La versión comercial de CHARMM se llama CHARMm (nótese la m minúscula), y está disponible a través de la compañía Accelrys.
Véase también
editarEnlaces externos
editar- Website de CHARMM con instructivos y útiles foros de discusión
- Página de CHARMM en Harvard
- VMD - Paquete para visualización de trayectorias CHARMM
- Tutorial de CHARMM (inglés) Archivado el 5 de octubre de 2010 en Wayback Machine.
- Website de MacKerell para bajar un paquete de campos de fuerza CHARMM utilizables en múltiples programas aparte de CHARMM
- Website de C. Brooks, desarrollador de CHARMM
- Website de Roux Archivado el 16 de octubre de 2014 en Wayback Machine., desarrollador de CHARMM
- Website de Bernard R. Brooks, desarrollador de CHARMM
- Website de Accelrys, soporte de la versión comercial
Referencias
editar- ↑ Brooks BR, Bruccoleri RE, Olafson BD, States DJ, Swaminathan S, Karplus M (1983). «CHARMM: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations». J Comp Chem 4: 187-217. doi:10.1002/jcc.540040211.
- ↑ MacKerell, A.D., Jr.; Brooks, C. L., III; Nilsson, L.; Roux, B.; Won, Y.; Karplus, M. (1998). «CHARMM: The Energy Function and Its Parameterization with an Overview of the Program». En Schleyer, P.v.R.; et al, ed. The Encyclopedia of Computational Chemistry 1. Chichester: John Wiley & Sons. pp. 271-277.
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Datos: Q902642
