Secretoma
El secretoma es el conjunto de proteínas, consecuencia de la expresión génica de un organismo, que es secretado al espacio extracelular. En humanos, este subconjunto del proteoma abarca un 13-20% de todas las proteínas, incluyendo citoquinas, factores de crecimiento, matrices extracelulares proteínas y reguladoras, y receptores de cabaña.
El secretoma de un tejido concreto puede ser medido por espectrometría de masa y su análisis constituye un tipo de proteómica conocida como secretómica.
Etimología
editarEl término secretoma fue acuñado por Tjalsma y otros en 2004 para indicar todos los factores que constituyen la vía secretoria de una célula.[1] En 2010, esta definición del secretoma fue revisada para incluir solo proteínas segregadas al espacio extracelular.[2] Conceptos relacionados incluyen el matrisoma, el cual es el subconjunto del secretoma que incluye proteínas de matrices extracelulares y sus proteínas asociadas;[3] el receptoma, el cual incluye todos receptores de membrana,[4] y el adenoma, el cual incluye todas las proteínas implicadas en adhesión de células.[5][6]
Ómica es un neologismo que en Biología Molecular se utiliza como sufijo para referirse al estudio de la totalidad o del conjunto de algo, como proteínas: proteomica o secretomica.
Cuantificación
editarLas proteínas segregadas en humanos forman el 13–20% del proteoma entero e incluyen factores de crecimiento, quimiocinas, citoquinas, moléculas de adhesión, proteasas y receptores de cabaña.[2] Genes de proteína humanos (39%, 19613 genes[7]) están pronosticados para tener tanto un péptido de señal y por lo menos una región transmembranal que sugiere un activo transporte de la proteína correspondiente fuera de la célula (secreción) o localizar uno de los numerosos sistemas de membrana en la célula.[8] Hay una variedad vasta de metodologías disponibles para estudiar secretomas de células vegetales, células animales, células madre y células cancerígenas.[9]
Véase también
editarReferencias
editar- ↑ Tjalsma, H.; Antelmann, H.; Jongbloed, J.D.H.; Braun, P. G.; Darmon, E.; Dorenbos, R.; Dubois, J.-Y.F.; Westers, H. et al. (8 de junio de 2004). «Proteomics of Protein Secretion by Bacillus subtilis: Separating the "Secrets" of the Secretome». Microbiology and Molecular Biology Reviews 68 (2): 207-233. PMC 419921. PMID 15187182. doi:10.1128/MMBR.68.2.207-233.2004.
- ↑ a b Agrawal GK.; Jwa NS.; Lebrun MH.; Job D.; Rakwal R. (February 2010). «Plant secretome: unlocking secrets of the secreted proteins». Proteomics 10 (4): 799-827. PMID 19953550. doi:10.1002/pmic.200900514.
- ↑ Hynes, R. O.; Naba, A. (21 de septiembre de 2011). «Overview of the Matrisome--An Inventory of Extracellular Matrix Constituents and Functions». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 4 (1): a004903. PMC 3249625. PMID 21937732. doi:10.1101/cshperspect.a004903.
- ↑ Ben-Shlomo, I.; Yu Hsu, S.; Rauch, R.; Kowalski, H. W.; Hsueh, A. J. W. (17 de junio de 2003). «Signaling Receptome: A Genomic and Evolutionary Perspective of Plasma Membrane Receptors Involved in Signal Transduction». Science Signaling 2003 (187): re9. PMID 12815191. doi:10.1126/stke.2003.187.re9.
- ↑ Zaidel-Bar, Ronen; Itzkovitz, Shalev; Ma'ayan, Avi; Iyengar, Ravi; Geiger, Benjamin (August 2007). «Functional atlas of the integrin adhesome». Nature Cell Biology 9 (8): 858-867. PMC 2735470. PMID 17671451. doi:10.1038/ncb0807-858.
- ↑ Horton, Edward R.; Byron, Adam; Askari, Janet A.; Ng, Daniel H. J.; Millon-Frémillon, Angélique; Robertson, Joseph; Koper, Ewa J.; Paul, Nikki R. et al. (19 de octubre de 2015). «Definition of a consensus integrin adhesome and its dynamics during adhesion complex assembly and disassembly». Nature Cell Biology 17 (12): 1577-1587. PMC 4663675. PMID 26479319. doi:10.1038/ncb3257.
- ↑ «Proteomics. Tissue-based map of the human proteome». Science 347 (6220): 1260419. January 2015. PMID 25613900. doi:10.1126/science.1260419.
- ↑ «Extracellular vesicle isolation and characterization: toward clinical application». The Journal of Clinical Investigation 126 (4): 1152-62. April 2016. PMC 4811150. PMID 27035807. doi:10.1172/JCI81129.
- ↑ «Methodologies to decipher the cell secretome». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1834 (11): 2226-32. November 2013. PMC 3652893. PMID 23376189. doi:10.1016/j.bbapap.2013.01.022.
Enlaces externos
editar- Esta obra contiene una traducción incompleta derivada de «Secretome» de Wikipedia en inglés, concretamente de esta versión, publicada por sus editores bajo la Licencia de documentación libre de GNU y la Licencia Creative Commons Atribución-CompartirIgual 4.0 Internacional.
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