La Temporada 2009 de las Grandes Ligas de Béisbol inició el domingo 5 de abril de 2009, con la victoria de los Bravos de Atlanta sobre los campeones de la Serie Mundial de 2008, los Filis de Filadelfia, por un marcador de 4-1. La temporada regular terminó el 6 de octubre, extendiéndose dos días debido al juego de definición entre los Tigres de Detroit y los Mellizos de Minnesota para decidir al campeón de la División Central de la Liga Americana. La postemporada comenzó al día siguiente con la Serie Divisional. La Serie Mundial, se inició el 28 de octubre y finalizó el 4 de noviembre, con la victoria de los Yanquis de Nueva York sobre los Filis de Filadelfia en seis partidos. Esta fue la segunda vez que se terminó la temporada en noviembre, la primera vez fue en la Serie Mundial de 2001, debido a los Atentados del 11 de septiembre. En esta ocasión la Liga Americana tuvo la ventaja de campo para la Serie Mundial por haber ganado el Juego de las Estrellas el 14 de julio en el Busch Stadium en San Luis, Misuri por 4-3.
El 15 de enero, los propietarios de los 30 equipos de Grandes Ligas aprobaron dos cambios en las reglas que rigen el juego de playoffs y los de postemporada.
Todos los "juegos de postemporada, y los agregados a la temporada regular", que se suspendan antes que las nueve entradas se jueguen. Se reanudarán cuando las condiciones lo permitan, en el mismo lugar desde el punto de suspensión. Este cambio en las reglas codifica la controvertida interpretación de las reglas oficiales hechas por el comisionado de MLB , Bud Selig, durante el Juego 5 de la Serie Mundial del 2008.
El lanzamiento de moneda ya no se utilizara para determinar la ventaja de local, en el desempate en un partido agregado, para determinar los campeones de división o comodín de liga. En cambio, se utiliza para determinar la ventaja de local, basándose en los enfrentamientos entre los clubes ligados. Esto se realizó por primera vez cuando los Tigres de Detroit y los Minnesota Twins, terminaron empatados en el liderato de la División Central de la Liga Americana, al final de la temporada regular (4 de octubre), el desempate en un partido se jugó el 6 de octubre en el Hubert H. Humphrey Metrodome. El juego no se pudo realizar el 5 de octubre a causa de un conflicto de programación con los Vikingos de Minnesota de la NFL, que fue sede contra los Green Bay Packers.
La temporada 2009 marcó la apertura de dos nuevos estadios en la ciudad de Nueva York , el Citi Field de los Mets y el Yankee Stadium de los yankees, los que sustituirán, respectivamente al Shea Stadium (que fue desmantelado durante el receso de temporada 2008-09) y el Yankee Stadium original (que se convertirá en un parque público una vez que sea demolido). Debido a que la capacidad de asientos es más reducida en estos nuevos estadios, el Dodger Stadium ahora es el parque con mayor capacidad con 56.000 asientos, además es el tercer estadio más antiguo de las Grandes Ligas detrás del Fenway Park y del Wrigley Field. El Citi Field se inauguró con un partido nocturno el 13 de abril cuando los Mets fueron locales ante los Padres de San Diego, perdiendo 6-5. En ese juego, Jody Gerut de los Padres se convirtió en el primer jugador en la historia de las Grandes Ligas en inaugurar estadio con un jonrón. Tres días más tarde, los Indios de Cleveland inauguran el nuevo estadio de los Yankees. Los Indios ganaron 10-2. El Día de Jackie Robinson (15 de abril), una rotonda del Citi Field fue nombrado en su honor, y se dedicó antes del juego entre los Mets y los Padres de ese día.