Uroporfirinógeno descarboxilasa

Uroporfirinógeno descarboxilasa
	; Representación de la estructura de la uroporfirinógeno descarboxilasa humana, mutación Ile260Thr.
Estructuras disponibles
PDB	Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Nomenclatura	Otros nombres Uroporfirinógeno III descarboxilasa, porfirinógeno carboxiliasa, porfirinógeno descarboxilasa, uroporfirinógeno III carboxiliasa
Símbolo	UROD (HGNC: 12591)
Identificadores; externos	OMIM: 613521 ; MGI: 98916 ; EBI: UROD; UniProt: UROD; Bases de datos de enzimas IntEnz: entrada en IntEnz; BRENDA: entrada en BRENDA; ExPASy: NiceZime view; KEGG: entrada en KEEG; PRIAM: perfil PRIAM; ExplorEnz: entrada en ExplorEnz; MetaCyc: vía metabólica
Número EC	4.1.1.37
Locus	Cr. 1 p34.1
Estructura/Función proteica
Tamaño	367 (aminoácidos)
Funciones	• Actividad uroporfirinógeno descarboxilasa;
Datos biotecnológicos/médicos
Enfermedades	Porfiria cutánea tarda, porfiria hepatoeritropoyética
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	v; t; e;
	[editar datos en Wikidata]

La uroporfirinógeno descarboxilasa (uroporfirinógeno III descarboxilasa o UROD) es una enzima perteneciente al grupo de las liasas codificada por el gen UROD.^[2]

Función

La uroporfirinógeno descarboxilasa es una enzima homodimérica que cataliza el quinto paso de la síntesis del grupo hemo, que se corresponde con la eliminación de grupos carboxilo de las cuatro cadenas laterales de acetato del uroporfirinógeno III para obtener coproporfirinógeno III:

uroporfirinógeno III $\rightleftharpoons$ coproporfirinógeno III + 4 CO
2

Importancia clínica

Las mutaciones de esta enzima causan porfiria cutánea tarda tipo II (familiar) y porfiria hepatoeritropoyética.^[2]

Mecanismo

A una concentración baja de sustrato, la reacción parece seguir un orden establecido en el que se eliminan los grupos carboxilos de los anillos D, A, B y C, mientras que a una concentración mayor de sustrato, el orden parece ser aleatorio. La enzima funciona como un dímero en disolución, y tanto las enzimas humanas como las del tabaco han sido cristalizadas y resueltas en alta resolución.

La reacción catalizada por UROD.

UROD es una descarboxilasa especial, ya que cataliza la reacción sin la intervención de cofactores, necesarios en la mayoría de descarboxilasas. Se ha propuesto que su mecanismo se produzca mediante la protonación del sustrato con un residuo de arginina.^[3] En 2008 se demostró que el ratio de la reacción de UROD sin catálisis es de 10⁻¹⁹ s⁻¹, por lo que a un pH de 10 la aceleración relativa en presencia de la enzima, o eficiencia enzimática, es el mayor de todas las enzimas conocidas, 6 x 10²⁴ M⁻¹.^[4]

Mecanismo propuesto para la reacción de la uroporfirinógeno descarboxilasa

Referencias

↑ «uroporphyrinogen decarboxylase [Homo sapiens]». NCBI (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020.
↑ ^a ^b «Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase» (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020.
↑ Silva, PJ; Ramos, MJ (2005). «Density-functional study of mechanisms for the cofactor-free decarboxylation performed by uroporphyrinogen III decarboxylase.». Journal of Physical Chemistry B (en inglés) 109: 18195-18200. doi:10.1021/jp051792s.
↑ Lewis, CA; Wolfenden, R (noviembre de 2008). «Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (en inglés) 105 (45): 17328-17333. PMC 2582308. PMID 18988736. doi:10.1073/pnas.0809838105.

Enlaces externos

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Datos: Q409065

[1] «uroporphyrinogen decarboxylase [Homo sapiens]». NCBI (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020.

[entrez-2] «Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase» (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020.

[3] Silva, PJ; Ramos, MJ (2005). «Density-functional study of mechanisms for the cofactor-free decarboxylation performed by uroporphyrinogen III decarboxylase.». Journal of Physical Chemistry B (en inglés) 109: 18195-18200. doi:10.1021/jp051792s.

[pmid18988736-4] Lewis, CA; Wolfenden, R (noviembre de 2008). «Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (en inglés) 105 (45): 17328-17333. PMC 2582308. PMID 18988736. doi:10.1073/pnas.0809838105.

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